PD-1在一些情况下会降低它的疗效。有JAK/B2M，要小心。发表在《Journal of Clinical Oncology》杂志，对于240名在美国纽约纪念斯隆-凯特琳癌症中心接受PD-1药物治疗的晚期肺癌患者的研究。发现，JAK蛋白（参与T细胞抗癌的战斗过程）和B2M蛋白（参与T细胞识别癌细胞的过程）缺失，很可能导致患者对PD-1抑制剂耐药。NLR≥4，影响PD-1的疗效。在一个涉及58名非小细胞肺癌患者的回顾性研究中，研究人员发现中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)可能也是PD-1/PD-L1抗体疗效的预测因子。治疗前中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）≥4的患者，总生存时间和疾病无进展时间更短。
LDH超过正常范围，PD-1疗效被影响。2016年，美国AACR年会公布了一项涉及145位肿瘤患者的临床研究数据，包括73位肺癌、32位恶黑和40位其他类型的肿瘤患者。研究人员发现，患者在使用PD-1抗体之前，如果乳酸脱氢酶LDH值在正常范围（105-300U/L）之内，肿瘤控制率比较高；如果LDH值超过正常范围，控制率比较低。
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