现时针对ROS1型肺癌的标靶药有酪氨酸激酶抑制剂，例如克唑替尼/赛可瑞。根据一项于2018年、针对亚洲ROS1型晚期肺癌病人的临床研究显示，服用克唑替尼的患者有72%客观反应率，有17人更达至完全反应，即肿瘤消失。此外，无恶化存活期中位数达15.9个月，比起多年前只有化疗的时候，由确诊至死亡往住只有9个月寿命，的确延长了很多。而克唑替尼的副作用不多，主要会出现肝酵素上升、眼睛不适和恶心等，而大多情况下并不严重。如果克唑替尼耐药，还有另一款药物：卡博替尼。
卡博替尼是一个非常神奇的抗癌药，据说可以同时抑制9个靶点，其中就包括ROS1融合：一个值得深入了解的广谱抗癌药：卡博替尼。更神奇的是，卡博替尼可能针对克唑替尼耐药的患者也有效。临床研究发现，ROS1融合的患者长时间使用克唑替尼，也会发生耐药，其中一个原因就是ROS1基因发生了基因突变，比如G2032R和D2033N突变。ALK的其它抑制剂比如色瑞替尼对这两个点位的突变的患者可能也无效，不过，有临床数据表明这个卡博替尼可能有效。
国外一位ROS1融合的患者，先使用克唑替尼，耐药后使用卡博替尼肿瘤完全消失的例子。这位肺癌患者50岁，肺腺癌，胸膜转移，先使用了培美+顺铂+贝伐的化疗方案进行治疗。后来通过基因检测发现了CD74-ROS1融合，使用克唑替尼进行治疗，每天250mg，一天两次，效果非常好，肿瘤缩小了64%。不幸的是，18个月之后，出现脑转移，克唑替尼部分耐药，医生对他进行了脑部放疗，同时继续使用克唑替尼治疗。
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